辣根和山葵的区别是味道不同，价格不同，颜色也是不同的。
辣根是十字花科马萝卜属，根部是呈浅黄白色，由于辣根比较耐寒且有很长的定植期，所以辣根的价格比较便宜，一般市面上的便宜“绿芥末”都是在辣根的基础上加入绿色色素进行伪装的。辣根的味道相较于山葵比较刺鼻且辣味浓郁。
山葵是十字花科山葵属，根状茎为绿色，山葵植株本来不含有辛辣物质，但当根状茎被研磨时，里面的芥子酶和硫葡糖苷发生反应，生成了辛辣的味道，但相较于辣根味道比较清新。由于山葵对生长环境非常挑剔，因此它的产量比较少，价格也比较昂贵。
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