菠萝蜜红肉和黄肉在颜色、果型、口感和出果率方面不同。
颜色：大多数的红肉菠萝蜜的颜色呈橙红色，只有极少数的红肉菠萝蜜呈大红色，大红色的菠萝蜜极其少见；黄肉菠萝蜜的颜色呈金黄色。
果型：红肉菠萝蜜的果型呈椭圆形，饱满圆润，大小适中；黄肉菠萝蜜的果型较长，个头也比较大。
口感：红肉菠萝蜜的果肉较厚，脆甜可口，香味比较浓厚，甜度高达25度；黄肉菠萝蜜的甜度不如红肉菠萝蜜，只有17度左右。
出果率：由于红肉菠萝蜜的果实饱满，果丝较少，所以出果率较高；黄肉菠萝蜜的果丝比较多，出果率相对比较低。
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